5/15/2018 0 Comments アミノ酸 コドン アンチコドン
タンパク質合成におけるtRNAとmRNAの相互作用.
アミノ酸 コドン アンチコドン 値段トランスファーRNA(略してtRNAと略され、可溶性RNAについては以前はsRNAと呼ばれていた)は、mRNAとタンパク質のアミノ酸配列との間の物理的リンクとして働く、典型的には76〜90ヌクレオチドの長さのRNAからなるアダプター分子である. tRNAは、メッセンジャーRNA(mRNA)中の3塩基の配列(コドン)が指示するように、細胞のリボソームのタンパク質合成機構にアミノ酸を運ぶことにより、.アミノ酸 コドン アンチコドン 違いこのように、tRNAは、翻訳の必要な成分、遺伝子コードによる新規タンパク質の生物学的合成である. 概要 mRNAの特定のヌクレオチド配列は、どのアミノ酸がmRNAが転写される遺伝子のタンパク質産物に組み込まれるかを特定するが、tRNAの役割は、遺伝子コードのどの配列がどのアミノ酸に対応するかを特定することである. mRNAは一連の連続したコドンとしてタンパク質をコードし、その各々は特定のtRNAによって認識される. tRNAの一方の末端は、アンチコドンと呼ばれる3ヌクレオチド配列中の遺伝暗号と一致する. アンチコドンは、タンパク質生合成中にmRNA中のコドンと3つの相補的な塩基対を形成する. tRNAのもう一方の末端には、アンチコドン配列に対応するアミノ酸への共有結合がある.アミノ酸 コドン アンチコドン クチコミ各タイプのtRNA分子は、1つのタイプのアミノ酸にのみ結合することができるので、各生物は、多くのタイプのtRNA. 遺伝コードには同じアミノ酸を特定する複数のコドンが含まれているため、同じアミノ酸を持つ異なるアンチコドンを持ついくつかのtRNA分子があります. tRNA 3末端への共有結合は、アミノアシルtRNAシンテターゼと呼ばれる酵素によって触媒される.アミノ酸 コドン アンチコドン 無料タンパク質合成中に、結合したアミノ酸を有するtRNAは、tRNAとリボソームとの会合、新しいポリペプチドの合成およびmRNAに沿ったリボソームの転座(移動)を助ける伸長因子と呼ばれるタンパク質によってリボソームに送達される. tRNAのアンチコドンがmRNAと一致する場合、既にリボソームに結合している別のtRNAは、新たに送達されたtRNAの3末端に結合したアミノ酸、リボソームによって触媒される反応. tRNA分子中の多数の個々のヌクレオチドは、しばしばメチル化または脱アミノ化によって化学的に修飾され得る.アミノ酸 コドン アンチコドン クチコミこれらの異常な塩基はtRNAのリボソームとの相互作用に影響を及ぼすことがあり、塩基対形成特性を変化させるためにアンチコドンで生じることがある. :29. 1. 2 構造 酵母由来のtRNAPheの二次クローバー葉構造.アミノ酸 コドン アンチコドン メニューtRNAの3次構造. CCA尾部が黄色、受容体が紫色、可変ループがオレンジ色、Dアームが赤色、アンチコドンアームが青色、アンチコドンが黒色、Tアームが緑色.アミノ酸 コドン アンチコドン 結合tRNAの構造は、その一次構造、その二次構造(通常はクローバー葉構造として視覚化される)、およびその三次構造(すべてのtRNAは、それらがPおよびA部位に適合することを可能にする同様のL字型3D構造を有するリボソームの). クローバーリーフ構造は、一般的なRNA三次構造モチーフであるヘリックスを同軸に積み重ねることにより3DのL字型構造となる. tRNA分子中の各アームの長さ、ならびにループの直径は、種によって異なる.アミノ酸 コドン アンチコドン 結合tRNA構造は、以下からなる: 5 '末端リン酸基. アクセプターステムは、5 '末端ヌクレオチドと3'末端ヌクレオチドとの塩基対形成によって作製された7~9塩基対(bp)ステムである(これは、アミノを結合させるために使用されるCCA 3 '酸). 一般に、そのような3 '末端tRNA様構造は、「ゲノムタグ」と呼ばれる。. アクセプターステムは、非ワトソン - クリック塩基対. CCAテイルは、3 '末端のシトシン - シトシン - アデニン配列であり、 tRNA分子の末端. アミノアシルtRNAシンテターゼによってtRNA上にロードされ、アミノアシルtRNAを形成するアミノ酸は、CCAテール上の3'-ヒドロキシル基と共有結合している.アミノ酸 コドン アンチコドン レシピこの配列は、酵素によるtRNAの認識に重要であり、翻訳において重要である. 原核生物では、CCA配列はいくつかのtRNA配列で転写される.アミノ酸 コドン アンチコドン ラクテン大部分の原核生物のtRNAおよび真核生物のtRNAにおいて、CCA配列はプロセシング中に付加され、したがってtRNA遺伝子には現れない. Dアームは、しばしばジヒドロウリジンを含むループで終わる4-6bpのステムである.アミノ酸 コドン アンチコドン ラクテンアンチコドンアームは5-bpステムであり、そのループにアンチコドン. tRNA 5 '→3'一次構造はアンチコドンを含むが、3 '→5' 5 '→3'方向からmRNAを読み取るためには指向性が必要である。.アミノ酸 コドン アンチコドン レシピTアームは、擬似ウリジンである配列T Cを含有する4〜5塩基対のステムであり、修飾ウリジン. 修飾された塩基、特にメチル化(e. g. tRNA(グアニン-N7 - ) - メチルトランスフェラーゼ)は、tRNA全体のいくつかの位置で生じる. 第1のアンチコドン塩基または揺動位置は、イノシン(アデニン由来)、シュードウリジンまたはリジン(シトシン由来)に修飾されることがあり、. アンチコドン アンチコドンは、mRNA上のコドンの3つの塩基に対応する3つのヌクレオチドから構成されるユニットである. 各tRNAは、アミノ酸の1つまたは複数のコドンに対して3つの相補的塩基対を形成し得る異なるアンチコドントリプレット配列を含む.アミノ酸 コドン アンチコドン 口コミいくつかのアンチコドンは、ウォブル塩基対形成として知られる現象のために、2つ以上のコドンと対合することができる. しばしば、アンチコドンの最初のヌクレオチドは、mRNA上に見いだされないヌクレオチドである:イノシンは、対応するコドン位置において2つ以上の塩基に水素結合することができる. :29. 3. 9遺伝子コードでは、1つのアミノ酸が4つの第3位の可能性のすべてによって、または少なくともピリミジンとプリンの両方によって特定されることが一般的である。例えば、アミノ酸グリシンは、コドン配列GGU、GGC、GGA、およびGGGによってコードされる. 他の修飾されたヌクレオチドはまた、時には「揺らぎ位置」として知られる第1のアンチコドン位置に出現して、例えばミトコンドリアにおけるように遺伝コードを微妙に変化させることがある. tRNA分子とアミノ酸を特定するコドンとの間に1対1の対応関係を設けるために、標準的な遺伝子コードの61個のセンスコドンが存在するため、61個のタイプのtRNA分子が細胞あたりに必要となる.アミノ酸 コドン アンチコドン ゆらぎしかしながら、多くの細胞は、特定のアミノ酸を特定するコドンのいくつか(必ずしも全てではない)に結合することができるので、61種類未満のtRNAを含む. 少なくとも31のtRNAが61のすべてのセンスコドンを明白に翻訳するために必要とされる. 観察される最大値は41. アミノアシル化 参照:アミノアシル-tRNA アミノアシル化は、化合物にアミノアシル基を付加するプロセスである.アミノ酸 コドン アンチコドン メニューこれは、アミノ酸をCCA 3 'に共有結合させる。 tRNA分子の末端. 各tRNAは、アミノアシルtRNAシンテターゼによって特定のアミノ酸でアミノアシル化(または荷電)される. 通常、アミノ酸には複数のtRNAおよび複数のアンチコドンが存在し得るにもかかわらず、各アミノ酸について単一のアミノアシルtRNAシンテターゼが存在する.アミノ酸 コドン アンチコドン 口コミシンテターゼによる適切なtRNAの認識は、アンチコドンによってのみ媒介されず、アクセプター幹はしばしば顕著な役割を果たす. 反応: アミノ酸+ ATPアミノアシル-AMP + PPi アミノアシル-AMP + tRNAアミノアシル-tRNA + AMP 特定の生物には、1つ以上のアミノアシルtRNAシンテターゼが欠けている可能性があります. これは、化学的に関連するアミノ酸によるtRNAの荷電を導く. 酵素または酵素は、荷電したアミノ酸を最終アミノ酸に修飾する. 例えば、ヘリコバクターピロリは、グルタミニルtRNAシンテターゼが欠損している. このように、グルタミン酸tRNAシンテターゼは、グルタミン酸を有するtRNA-グルタミン(tRNA-Gln).アミノ酸 コドン アンチコドン 意味次いで、アミドトランスフェラーゼはグルタミン酸の酸側鎖をアミドに変換し、正しく帯電したgln-tRNA-Glnを形成する. リボソームへの結合 メディアを再生する tRNAがリボソーム上のP / E部位を介してA / Tを通過する際に採用されるコンフォメーションの範囲. アニメーションのエンドポイントとして使用される構造モデルのためのタンパク質データバンク(PDB)コードが与えられる. 両方のtRNAは、エシェリヒア・コリからのフェニルアラニン特異的tRNAとしてモデル化され、A / T tRNAは、寄託された座標の相同性モデルである. tRNA三次構造について示されるような色のコーディング. 適応. リボソームは、2つのリボソームサブユニットの間の空間、すなわちA(アミノアシル)、P(ペプチジル)およびE(出口)部位の3つの結合部位を有する.アミノ酸 コドン アンチコドン 口コミさらに、リボソームは、mRNAデコード中またはタンパク質合成の開始中に使用されるtRNA結合のための2つの他の部位を有する. これらは、T部位(伸長因子Tuと名付けられた)およびI部位(開始部位). 慣例により、tRNA結合部位は、最初にリストされた小さなリボソームサブユニット上の部位で示され、大きなリボソームサブユニット上の部位は、. 例えば、AサイトはA / A、Pサイト、P / P、Eサイト、E / E. AおよびP部位のL27、L2、L14、L15、L16のような結合タンパク質は、A. P. Czernilofskyら. (Proc. Natl. Acad. Sci、USA、pp 230 230 234、1974).アミノ酸 コドン アンチコドン ラクテン翻訳開始が完了すると、最初のアミノアシルtRNAはP / P部位に位置し、以下に記載する伸長サイクルの準備が整う. 翻訳伸長の間、tRNAは伸長因子Tu(EF-Tu)またはその真核生物(eEF-1)または古細菌の対応物との複合体の一部として最初にリボソームに結合する. この最初のtRNA結合部位はA / T部位と呼ばれる. A / T部位において、A部位の半分は、mRNAデコード部位が位置する小リボソームサブユニットに存在する. mRNAデコード部位は、翻訳中にmRNAコドンが読み出される部位である. T-部位の半分は、主に、EF-TuまたはeEF-1がリボソームと相互作用する大きなリボソームサブユニットに存在する.アミノ酸 コドン アンチコドン ゆらぎmRNAの解読が完了すると、アミノアシルtRNAはA / A部位に結合し、次のペプチド結合がその結合したアミノ酸に形成される準備が整う. 成長中のポリペプチドをA / A部位に結合したアミノアシルtRNAに転移させるペプチジルtRNAは、P / P部位に結合している. ペプチド結合が形成されると、P / P部位のtRNAは脱アシル化されるか、または遊離3末端を有し、A / A部位のtRNAは成長するポリペプチド鎖.アミノ酸 コドン アンチコドン 意味次の伸長サイクルを可能にするために、サイクルを完了させてP / PおよびE / E部位に存在する前に、tRNAをハイブリッドA / PおよびP / E結合部位を通過させる. A / AおよびP / P tRNAがP / PおよびE / E部位に移動すると、mRNAもまた1コドン移動し、A / T部位は空であり、次のmRNAデコーディングの準備が整う.アミノ酸 コドン アンチコドン 口コミE / E部位に結合したtRNAがリボソームを離れる. P / I部位は実際に細菌中でIF2と呼ばれる開始因子によって送達されるアミノアシルtRNAに最初に結合する.アミノ酸 コドン アンチコドン レシピしかし、真核生物または古細菌のリボソームにおけるP / I部位の存在はまだ確認されていない. P部位タンパク質L27は、E. CollatzとA. P. チェルノフスキー(FEBS Lett. 、Vol. 63巻、283 286頁、1976年). tRNA遺伝子 生物はゲノム中のtRNA遺伝子の数が異なる. 線虫ワームC. エレガンスは、遺伝学研究でよく使用されるモデル生物であり、その核ゲノムには29,647個の遺伝子を有し、そのうち620個のtRNAコード.アミノ酸 コドン アンチコドン レシピ出芽酵母Saccharomyces cerevisiaeはそのゲノム中に275個のtRNA遺伝子を有する. 2013年1月に推定されるヒトゲノムには、合計で約20,848個のタンパク質コード遺伝子があり、細胞質tRNA分子をコードする核遺伝子は497個であり、もはや機能的ではないと考えられる324個のtRNA由来の偽遺伝子tRNA遺伝子(疑似tRNA細菌における抗生物質耐性に関与することが示されている). ミトコンドリアtRNA遺伝子と配列が非常に類似している核染色体の領域も同定されている(tRNA-ルックアライキ). これらのtRNA-ルックアライメントはまた、核ミトコンドリアDNA(ミトコンドリアから核に移された遺伝子)の一部と考えられ、. すべての真核生物と同様に、ヒトには22種のミトコンドリアtRNA遺伝子が存在する. これらの遺伝子のいくつかの突然変異は、MELAS症候群.アミノ酸 コドン アンチコドン 値段細胞質tRNA遺伝子は、それらのアンチコドン特徴に従って49家族に分類することができる. これらの遺伝子は、22およびY染色体を除くすべての染色体上に見出される. 6p上の高いクラスタリングが観察され(140個のtRNA遺伝子)、1個の染色体. HGNCは、ゲノムtRNAデータベース(GtRNAdb)およびこの分野の専門家と協力して、tRNAをコードするヒト遺伝子のユニークな名前を承認しました.アミノ酸 コドン アンチコドン 口コミ進化 tRNAの上半分(5 '末端リン酸基および3'末端CCA基を有するDアームおよびアクセプターステムからなる)および下側半分(Tアームおよびアンチコドンアームからなる)は、構造上独立した単位である機能に加えて. 上の半分は、初期のRNA世界で複製のために本来tRNA様分子をマークした3 '末端のゲノムタグをはじめに進化しているかもしれない.アミノ酸 コドン アンチコドン ラクテン下半分は後で拡張として発展したかもしれない。e. g. タンパク質合成はRNA世界で始まり、リボ核タンパク質世界(RNP世界). この提案されたシナリオは、ゲノムタグ仮説.アミノ酸 コドン アンチコドン 結合実際、tRNAおよびtRNA様凝集体は、重要な触媒的影響を有する(i. e. リボザイムとしての). これらの役割は、「分子(または化学)胞子」とみなされ得る。 RNA世界の. ゲノムtRNA含量は、生命の生物学的ドメイン間のゲノムの差異的特徴である:古細菌は、遺伝子コピー数が均一なゲノムtRNA含量に関して最も単純な状況を示し、細菌は中間的状況を有し、Eukaryaは最も複雑な状況. Eukaryaは、他の2つの王国よりも多くのtRNA遺伝子の内容だけでなく、異なるイソアセプタの遺伝子コピー数の高い変動も示しており、この複雑さはtRNA遺伝子の重複やアンチコドン特異性の変化によるものと思われる.アミノ酸 コドン アンチコドン 閉店異なる種にわたるtRNA遺伝子コピー数の進化は、特定のtRNA修飾酵素(細菌中のウリジンメチルトランスフェラーゼおよびEukarya中のアデノシンデアミナーゼ)の出現と関連しており、これは所与のtRNAの解読能力を増加させる. 一例として、tRNAAlaは、4つの異なるtRNAアイソアクセプター(AGC、UGC、GGCおよびCGC).アミノ酸 コドン アンチコドン 結合Eukaryaにおいて、AGCイソアセプタは、他のイソアセプタと比較して遺伝子コピー数が非常に富化されており、これは、そのウォブルベースのA対Iの変更と相関している. この同じ傾向は、真核生物種のほとんどのアミノ酸について示されている.アミノ酸 コドン アンチコドン 無料実際に、これらの2つのtRNA修飾の効果は、コドン使用頻度バイアス. 高度に発現された遺伝子は、これらの修飾されたtRNAによってデコードされるコドンを専ら使用するコドンにおいて濃縮されているようであり、これらのコドンおよび翻訳効率におけるこれらのtRNA修飾の可能な役割を示唆する. tRNA由来断片 tRNA由来断片(またはtRF)は、成熟tRNAまたは前駆体転写産物の切断後に出現する短鎖分子である.アミノ酸 コドン アンチコドン 意味細胞質およびミトコンドリアの両方のtRNAは、. 比較的長いtRNA半減期および短い5-tRF、3-tRFおよびi-tRFを含む、成熟tRNAに由来すると考えられる少なくとも4つの構造タイプのtRFが存在する.アミノ酸 コドン アンチコドン 閉店前駆体tRNAを切断して、5つのリーダー配列または3つのトレイル配列から分子を生成することができる. 切断酵素には、アンギオゲニン、ダイサー、RNアーゼZおよびRNアーゼPが含まれる.アミノ酸 コドン アンチコドン 違い特にアンギオゲニンの場合、tRFは、その3つの末端に特徴的に珍しい環状ホスフェートを有し、5つの末端にヒドロキシル基を有する. tRFには複数の依存関係と役割があります.アミノ酸 コドン アンチコドン 値段性別、人種および病状の間で有意な変化を示す. 機能的には、それらはAgoにロードされ、RNAi経路を介して作用し、ストレス顆粒の形成に関与し、RNA結合タンパク質からのmRNAを置換し、または翻訳を阻害する.アミノ酸 コドン アンチコドン 結合システムまたは生物レベルで、4つのタイプのtRFは、多様な活動のスペクトルを有する. 機能的には、tRFはウイルス感染、癌、細胞増殖および代謝のエピジェネティックなトランスジェネレーション調節に関連する.アミノ酸 コドン アンチコドン ゆらぎtRFはヒトに限定されず、複数の生物に存在することが示されている. ミトコンドリアおよび核tRNAフラグメント(MINTbase)のインタラクティブな探索のためのフレームワーク、およびトランスファーRNA関連フラグメント(tRFdb)のリレーショナルデータベースは、tRFに関する詳細を学ぶための2つのオンラインツールがあります。. MINTbaseはまた、ゲノムに依存しないtRF-ナンバープレートと呼ばれるtRFの命名法を提供しています. tRNA生合成 真核細胞では、tRNAは核内のプレ-tRNAとしてRNAポリメラーゼIIIによって転写される.アミノ酸 コドン アンチコドン ゆらぎRNAポリメラーゼIIIは、2つの高度に保存された下流のプロモーター配列を認識する:5 ' (5'-ICR、D-コントロール領域、またはAボックス)、およびtRNA遺伝子内の3'-ICR(T-コントロール領域またはBボックス). 第1のプロモーターは成熟tRNAの+8から始まり、第2のプロモーターは第1のプロモーターの30〜60ヌクレオチド下流に位置する. 転写は、4つ以上のチミジンの伸長後に終了する.アミノ酸 コドン アンチコドン 無料tRNAイントロンのバルジヘリックスバルジモチーフ Pre-tRNAは核内で大規模な修飾を受ける. いくつかのプレtRNAは、機能的tRNA分子を形成するためにスプライシングまたは切断されたイントロンを含む。バクテリアではこれらが自己スプライスであるのに対し、真核生物および古細菌ではそれらはtRNAスプライシングエンドヌクレアーゼによって除去される. 真核生物のpre-tRNAは、エンドヌクレアーゼによるtRNAイントロンの認識および正確なスプライシングに重要なバルジヘリックスバルジ(BHB)構造モチーフを含む. このモチーフの位置および構造は進化的に保存されている.アミノ酸 コドン アンチコドン ラクテンしかしながら、単細胞藻のようないくつかの生物は、スプライスされたイントロン配列の5 'および3'末端と同様にBHBモチーフの非標準的位置を有する. 5 '配列はRNアーゼPによって除去され、一方、3 '末端は、tRNAase Z酵素によって除去される. 注目すべき例外は、RNase P酵素を有さない古細菌Nanoarchaeum equitansにあり、転写が5 '末端で開始するように配置されたプロモーターを有する。成熟tRNAの末端. テンプレート化されていない3 ' CCAテールは、ヌクレオチジルトランスフェラーゼ. tRNAがLos1 / Xpo-tによって細胞質に輸出される前に、tRNAをアミノアシル化する. 処理イベントの順序は保存されていません.アミノ酸 コドン アンチコドン 値段例えば、酵母では、スプライシングは核ではなく、ミトコンドリア膜の細胞質側で行われる. 歴史 tRNAの存在は、RNAアルファベットのタンパク質アルファベットへの翻訳を媒介することができるアダプター分子が存在しなければならないという仮定に基づいて、Francis Crickによって最初に仮定された. 構造に関する重要な研究は、ボストンの2人の研究者、プリンストン大学のジャック・フレスコ(Jacques Fresco)グループ、およびロンドンのキングズ・カレッジ(King's College of London)のイギリスのグループであるAlex RichとDon Caspar.アミノ酸 コドン アンチコドン レシピ1965年、ロバート・W. コーネル大学のホーリーは一次構造を報告し、3つの二次構造. tRNAは、ロバートMによってウィスコンシン州マディソンで最初に結晶化された.アミノ酸 コドン アンチコドン 口コミボック. クローバー葉の構造は、その後数年間にいくつかの他の研究によって確認され、1974年にX線結晶学の研究を用いて最終的に確認された.アミノ酸 コドン アンチコドン レシピ2人の独立したグループ、アレクサンダー・リッチの下で働くキム・ソンホーとアーロン・クルグが率いるイギリスのグループは、1年以内に同じ結晶学的所見を発表した. も参照してください tRNAのクローバーリーフモデル 金ソンホウ ステムループにキスする mRNA 非コードRNAおよびイントロン スリッパリシーケンス tmRNA トランスファーRNA様構造 翻訳 tRNADB ウォブル仮説 アミノアシルtRNA 参考文献 ^ Plescia、OJ; Palczuk、N C; Cora-Figueroa、E;ムケルジー、A;ブラウン、W(1965年10月). 「可溶性RNA(sRNA)に対する抗体の産生」.アミノ酸 コドン アンチコドン 無料Proc. 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